全球播報:國家標準《單細胞測序樣本采集與處理規范》征求意見
(資料圖片僅供參考)
近日,國家標準計劃《單細胞測序樣本采集與處理規范》已完成征求意見稿,目前正公開征求意見。該文件由TC559(全國生物樣本標準化技術委員會)歸口,主要起草單位為深圳華大生命科學研究院。意見征集截至2022年12月20日。
目前廣泛應用的二代測序(NGS)技術,是基于整個細胞群體的分析,不能觀察細胞的異質性。單細胞測序(SCS)則是在單個細胞水平上,對基因組或轉錄組進行擴增并測序,可實現在單細胞水平對疾病和生物學過程中的遺傳學特征進行研究。經過10余年的發展,單細胞測序技術在腫瘤、生殖、免疫等等許多生物醫學領域研究中都取得了眾多成果。
制備單細胞懸液是單細胞測序實驗和數據分析的基礎。制備流程主要分外周血樣本、組織樣本、貼壁細胞三種樣本單細胞懸液制備基本流程。對于大多數類型的細胞,單細胞懸液的制備并不困難,但懸液的質量主要取決于實驗人員的操作水平。在懸液制備過程中,細胞活性、組織類型、雜質量等都將影響懸液的最終質量。同時單細胞分選有多種方法,實際使用時需根據樣本的實際情況和研究目的來選擇合適的方法。
目前單細胞測序領域尚無相關的標準,對于單細胞測序樣本的采集和處理缺 乏系統的設計和規范,無法保證采集和處理方法的重復性和穩定性,進而無法保 證經處理的樣本符合最終的使用要求。
《單細胞測序樣本采集與處理規范》規定了單細胞測序樣本采集與處理的基本要求。主要技術內容包括單細胞測序的樣本采集、不同樣本類型預處理方法選擇、處理過程、相關技術指標及保存運輸要求等。適用于人和動物血液與組織、植物組織、細胞系及其他特殊單細胞測序待檢樣本的采集與處理。
該標準的制訂提供了統一的單細胞測序樣本預處理方法指南,有助于促進單細胞測序推動我國基礎研究的發展,提升我國在生命科學研究的整體創新能力和國際競爭力。
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